คำถามในหัวข้อ 'fasta'
การเปลี่ยนส่วนหัวของ fasta เพื่อให้มีข้อมูลการนับ
ฉันมีไฟล์ที่มีหลายแถวดังนี้:
fg-000001 ATGGATGACCGATGCTAGC 34 23 33 45 34 23 34 35 34 35 56 47
ฉันต้องการแปลงเป็นไฟล์ fasta โดยมีผลรวมของข้อมูลการนับพร้อมกับชื่อไฟล์ fasta
fg-000001_x433 ATGGATGACCGATGCTAGC
เป็นไปได้ไหม?...
30 มุมมอง
schedule
10.11.2023
การรวมลำดับ DNA จากสองไฟล์ภายใต้ชื่อสปีชีส์เดียวกัน
ฉันมีไฟล์ FASTA สองไฟล์ที่มีลำดับ DNA ที่เข้ารหัสสำหรับโปรตีนสองชนิดที่แตกต่างกัน ฉันต้องการรวมลำดับของโปรตีนต่างๆ และสปีชีส์เดียวกันเข้าด้วยกันเป็นลำดับยาวๆ ลำดับเดียว
ตัวอย่างเช่น ฉันมี:
Protein 1
>sce
AGTAGATGACAGCT
>act
GCTAGCTAGCT...
125 มุมมอง
schedule
19.11.2023
คุณสามารถไปป์ไลน์จาก FTP เพื่อดึงข้อมูลหลายไฟล์ได้หรือไม่
ฉันกำลังพยายามดึงจีโนมหลายร้อยรายการจาก NCBI และไปป์พวกมันไปยังเซิร์ฟเวอร์ Phaster (โดยตรงหรือผ่านเซิร์ฟเวอร์ในเครื่องของฉัน) คุณสามารถไพพ์เอาต์พุตของ FTP ที่ดึงข้อมูลหลายไฟล์ในคำสั่งเดียวได้หรือไม่? ฉันได้ลองใช้ rsync และ wget แล้ว
FTP...
37 มุมมอง
schedule
05.01.2024