baris umum antara 2 file teks di baris perintah linux

Saya memiliki 2 file teks. yang pertama seperti ini:

DB  41533499    41533500    14
CD  41533500    41533501    3
AR  41533504    41533505    5
DR  41533506    41533507    3
AR  41533508    41533509    1
AR  48743349    48743350    1

dan yang ke-2 terlihat seperti ini:

DB  41533400    41533600
DR  41533300    41533800
AR  41533200    41533800
AR  48743100    48743983

selisih kolom ke-2 dan ke-3 adalah 1 yang berarti satu poin. Saya ingin membuat file baru yang kolom ke-1 sama antara 2 file dan juga rentang kolom ke-2 dan ke-3 di file 2 berada di rentang kolom ke-2 dan ke-3 di file2. inilah output yang diharapkan:

DB  41533400    41533600    41533499    41533500    14
DR  41533300    41533800    41533506    41533507    3
AR  41533200    41533800    41533508    41533509    1
AR  48743100    48743983    48743349    48743350    1

Saya mencoba melakukan di baris perintah linux dan menulis yang berikut ini tetapi tidak mendapatkan apa yang saya inginkan:

awk '{print $1 "\t" $2 "\t" $3 "\t" }' file2.txt '{print $1 "\t" $2 "\t" $3 "\t" $4 }' file1.txt > output.txt

apakah kamu tahu cara memperbaikinya?


awk
person ARM    schedule 14.12.2017    source sumber
comment
jelaskan, mengapa entri AR 41533504 41533505 5 ini harus dilewati?   -  person RomanPerekhrest    schedule 14.12.2017
comment
karena tidak ada baris yang sesuai di file ke-2   -  person ARM    schedule 14.12.2017
comment
itu terdengar meragukan...   -  person RomanPerekhrest    schedule 14.12.2017
comment
AR 41533504 41533505 cocok dengan AR 41533200 41533800 di file2 berdasarkan logika yang Anda jelaskan. Mungkin ada kendala lain seperti keunikan?   -  person karakfa    schedule 14.12.2017

Jawaban (2)


arrow_upward
1
arrow_downward

Ini satu untuk GNU awk tapi saya membagikan pertanyaan yang sama dengan @RomanPerekhrest tentang rekor AR 41533504 41533505 5:

$ awk 'NR==FNR{
    a[$1][$2]=$3; next
}
($1 in a) {
    for(i in a[$1])
        if($2>=i && $3 <= a[$1][i])
            print $1,i,a[$1][i],$2,$3,$4
}' file2 file1
DB 41533400 41533600 41533499 41533500 14
AR 41533200 41533800 41533504 41533505 5
DR 41533300 41533800 41533506 41533507 3
AR 41533200 41533800 41533508 41533509 1
AR 48743100 48743983 48743349 48743350 1
person James Brown    schedule 14.12.2017

arrow_upward
0
arrow_downward

berdasarkan interpretasi bebas saya terhadap persyaratan berdasarkan baris yang hilang

dengan pipa, bukan satu skrip awk (sudah dijawab)

$ join <(sort file2) <(sort file1) | # sort and join on key (1st field)
  awk '$2<$4 && $3>$5'             | # apply within range logic
  sort -k6n                        | # sort ascending based on last field
  awk '!a[$2]++'                   | # pick first instance of 2nd field (the lowest) 
  tac                                # reverse to be in descending order


DB 41533400 41533600 41533499 41533500 14
DR 41533300 41533800 41533506 41533507 3
AR 48743100 48743983 48743349 48743350 1
AR 41533200 41533800 41533508 41533509 1
person karakfa    schedule 14.12.2017