Вероятно, это проблема с бэкэндом macosx для matplotlib. Переключитесь на использование альтернативного бэкенда для matplotlib (например, используйте qt4 вместо 'macosx'). Подробнее о том, как переключить серверную часть и что именно это означает, см. в здесь. Обратите внимание, что вам, возможно, придется сначала установить серверную часть - например. pyqt использовать qt4agg серверную часть, как я предлагаю здесь.

Таким образом, серверная часть имеет дело с выводом из matplotlib, а matplotlib может ориентироваться на разные форматы вывода. Это могут быть выходные форматы графического интерфейса (например, wx, qt4 и т. д.) или выходные файлы (например, pdf). Они известны как интерактивные и неинтерактивные серверные части соответственно.

Чтобы изменить бэкэнд, выполните

import matplotlib
matplotlib.use('qt4agg')

в коде или, если вы хотите изменять каждый раз при запуске matplotlib, отредактируйте настройки файла matplotlibrc внутренний атрибут, например.

backend: Qt4Agg

Н.Б. Меня предупредил комментарий о том, что после публикации этого ответа документы matplotlib теперь ссылаются на эту проблему и предлагают обходной путь, хотя Комментатор отметил, что решение, предложенное в этом ответе (переключиться на бэкэнд Qt), сработало для них, где обходной путь с официальной документацией был для них невозможен.

Что, наконец, сработало для меня, так это создать локальный файл matplotlibrc, содержащий директиву: backend: TkAgg.

# Within working directory where running python
vim matplotlibrc
# new file via vim, Nano, whatever
backend: TkAgg

Это было полезно:

import matplotlib
print matplotlib.rcParams['backend']

Другие примечания:

Я также установил pyqt с помощью Homebrew (brew install pyqt) и скопировал (мог просто переместить) в $MyVirtEnv/lib/python2.7/site-packages/ из /usr/local/lib/python2.7/site-packages/PyQt4

Но когда я

import matplotlib
matplotlib.use('qt4Agg')
import librosa
 "Matplotlib qt-based backends require an external PyQt4, PyQt5,\n"
ImportError: Matplotlib qt-based backends require an external PyQt4,   PyQt5,
or PySide package to be installed, but it was not found.

Тоже пробовал

pip install pyside
Successfully installed pyside-1.2.4

Та же ошибка

>>> import pyside
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
ImportError: No module named pyside

Также в какой-то момент возникла следующая ошибка при попытке повторно импортировать matplotlib (я думаю).

from . import cache
ImportError: cannot import name cache

Как указано в Часто задаваемые вопросы о Matplotlib virtualenv, vext — вот решение.

Например, это позволяет использовать общесистемный pyqt5.

Это необходимо до тех пор, пока программа установки PyQt5 не узнает о virtualenvs:

pip3 install vext.pyqt5

Просто добавьте plt.show() в конце, и проблема для меня была решена.